傍晚或夜間從始發站出發，並於翌晨以後抵達目的地車站的夜行列車。在鐵路曾是國內移動主角的年代，夜行列車曾在全國各地運行，但隨著其他交通工具的發達等因素，數量逐漸減少。到了2026年現在，作為定期列車運行的只剩下「Sunrise瀨戶」與「Sunrise出雲」兩列車。
不過，如果把臨時列車也包括在內，最近夜行列車正逐漸增加。
JR西日本於2020年作為全新長距離列車，開始運行「WEST EXPRESS 銀河」。這列車使用由過去曾在新快速等列車上使用的117系改造而成的車輛，主要在山陰、山陽、紀南方向，以日間行車與夜行交替運行。
車內除了一般的可後躺座椅外，還設有可作為床鋪的綠色個室、包廂式座位，以及有如昔日藍色列車2層臥鋪般的「couchette」。正如其概念所示，這是一個也預想用於夜行列車運用的空間。
JR東日本也已發表，將於2027年度導入可對應夜行運行的新特急列車「Luna Azul」。這款列車將改造E657系而成，預定於春季至秋季之間，作為東京至東北方面的夜行列車運行。
