截至2026年6月，中央・總武線各站停車上，JR車輛已全部統一為E231系。
該線使用的E231系分為3種類。其中藍色車帶的800番台是為東京地下鐵東西線直通而配置的車群，JR線路段僅行走三鷹～中野區間及西船橋～津田沼區間。
剩下的兩種類則披著黃色車帶。多數為車頭為白色的500番台，但也有少數車頭為銀色的編成存在。
車頭為銀色的這一群，是新製投放到中央・總武線各站停車的0番台；截至2026年6月僅存6編。
E231系的原型車為209系950番台（後來的E231系900番台），1998年登場，翌年1999年開始在中央・總武線各站停車投入營運。量產車於2000年登場，投入與試作車相同的中央・總武線各站停車，取代了原先運行的103系、201系與205系。中央・總武線各站停車用的0番台在全盛期曾有46編配置於三鷹車輛中心，與900番台、209系500番台共同運用。
轉捩點出現在2014年：原本在山手線運行的一編E231系500番台被轉屬為中央・總武線各站停車車輛。此後，2015年登場的E235系陸續投入山手線，被替換下來的E231系500番台便相繼轉屬至中央・總武線各站停車；209系500番台與E231系的0・900番台也隨之逐步被取代。
被中央・總武線各站停車淘汰的209系500番台與E231系，轉屬到武藏野線、八高・川越線（改造為209系3500番台與E231系3000番台）。另外，其中2編E231系在2015年上野東京線開業時轉屬到常磐線快速。
不過，E231系500番台並未完全取代所有0番台，完成調配後仍有6編0番台留存。這些殘存編成為了與500番台規格一致，將編成由4M6T（10輛編成中4輛為動力車）改為6M4T（6輛動力車）。不過車內設備並未全面改裝，500番台在車門上方裝有資訊導覽／廣告用LCD，而0番台仍維持LED式的導覽顯示器。