東京23區內擁有多條鐵路線，移動十分方便。不過，並不是所有23區都有JR線通過，其中有些區域僅由私鐵路線覆蓋。
沒有JR線的區域有練馬區和世田谷區。練馬區有西武池袋線・新宿線・西武有樂町線・豐島線、都營地下鐵大江戶線、東京地鐵有樂町線・副都心線等七條路線，而世田谷區則有小田急小田原線、東急東橫線・田園都市線・目黑線・世田谷線、京王線・井之頭線共七條路線。然而，兩個區域至最近的JR線（中央線、埼京線或橫須賀線）距離都比較遠，與JR線的營業區域分開。
另外，目黑區雖然有山手線經過，但卻沒有JR車站。與區名相同的目黑車站並不在目黑區內，而是在品川區。另一個鄰近車站恵比壽站也位於鄰近的澀谷區內。
雖然世田谷區沒有JR線，但在內部運行的小田急線卻有JR的車輛（常磐緩行線用的E233系）進入。如果考慮車輛日常通過的情況，則在東京23區中，只有練馬區與JR完全無緣。
