JR東日本的車輛基地過去以「東京綜合車輛中心」、「松本車輛中心」、「鎌倉車輛中心中原支所」等名稱稱呼。不過到了七月，已有目擊報告指出這些名稱已被更改。
向JR東日本的公關人員詢問後，他們表示，7月1日以降，車両センター改稱為「車輛基地」，総合車両センター為「綜合車輛基地」，○○車両センター△△支所則為「○○車輛基地（△△）」。例如：東京総合車両センター改為「東京綜合車輛基地」、松本車両センター改為「松本車輛基地」、鎌倉車両センター中原支所改為「鎌倉車輛基地（中原）」。
此外，雖然不是車輛所屬基地，公關人員也說，過去所謂的「乘務員區」等，將改稱為「乘務基地」。
本次名稱變更，與JR東日本於7月1日實施的事業運營體制改革有關。
過去JR東日本在在來線的各現業部門中，第一線的現場（如車站組織、乘務員組織、車輛基地）由2個本部（首都圈本部、東北本部）及10個支社（如橫濱支社、新潟支社等）管轄，然後再由本社統轄這些地方機關。
公司為了實現於2025年7月發表的集團經營願景「勇翔2034」所描繪的目標，決定改革沿用自國鐵時代、以區域劃分而導致的單一化運營體制，以及本社、本部/支社與第一線職場的三層結構，因而推動本次事業運營體制改正。
因此，地方機關將依據各地市場與利用狀況等，重組為36個區域機關「事業本部」。例如，首都圈本部被劃分為「東京」「上野」「品川」「澀谷」「新宿」「池袋」「松戶」7個事業本部，橫濱支社則分為「橫濱」「川崎」「湘南伊豆」3個事業本部。另外，本社內部組織也在功能上分為集團戰略部門與事業執行部門。
JR東日本的公關人員說明：「我們進行組織改正的目的是要超越『理所當然』，加速融合與協同，以創造新的價值。」透過這些新組織，公司將以「貼近在地的事業經營」「具有速度感的經營」與「擴大員工發揮舞台」為目標。
車輛基地與乘務員部門的名稱變更，也與事業本部的重編有密切關係。
在本次組織重編下，員工將在各事業本部中，跳脫過去「部」「單位」等組織框架，跨領域參與多種業務並廣泛發揮。因此，員工的所屬將統一記為「○○事業本部」。
不過，對旅客與對外來說，有必要讓人一目了然員工主要從事的業務，因此公關人員表示，車輛基地與乘務員部門的名稱已被整理為更容易理解的稱呼。